非法占用农用地罪的立案标准如下：
1、非法占用并毁坏防护林地、特种用途林地数量分别或合计达五亩以上；
2、非法占用并毁坏其他林地数量达到十亩以上；
3、非法占用并毁坏其他林地数量达到十亩以上；
4、非法占用其他农用地数量较大的情形。
法律依据：《中华人民共和国刑法》第三百四十二条
【非法占用农用地罪】违反土地管理法规，非法占用耕地、林地等农用地，改变被占用土地用途，数量较大，造成耕地、林地等农用地大量毁坏的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。
第三百四十二条之一
【破坏自然保护地罪】违反自然保护地管理法规，在国家公园、国家级自然保护区进行开垦、开发活动或者修建建筑物，造成严重后果或者有其他恶劣情节的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。
有前款行为，同时构成其他犯罪的，依照处罚较重的规定定罪处罚。
非法占用农用地罪的构成要件是什么
1、客体要件，侵犯的客体是国家的土地管理制度；
2、客观要件，在客观方面表现为违反土地管理法规，非法占用农用地改作他用，数量较大，造成农用地大量毁坏的行为；
3、主体要件，主体既可以是自然人，也可以是单位；
4、主观要件，在主观方面表现为故意。
