夫妻双方户口不在一起，孩子是能落户的，可以选择夫妻任意一方户口所在地落户。户籍登记制度规定，孩子的户口，可以随父，也可以随母。父母户口不在一起孩子上户口的办法：由户主、亲属、抚养人或者邻居，携带相关材料向婴儿常住地户口登记机关申报出生登记即可。且一般自婴儿出生后一个月以内办理。新生儿出生一个月以内,新生儿父母或监护人凭《出生医学证明》、持《居民户口簿》到新生儿常住地户口登记机关申报出生登记。法律依据《中华人民共和国户口登记条例》第三条 户口登记工作，由各级机关主管。城市和设有派出所的镇，以派出所管辖区为户口管辖区;乡和不设派出所的镇，以乡、镇管辖区为户口管辖区。乡、镇人民委员会和派出所为户口登记机关。居住在机关、团体、学校、企业、事业等单位内部和公共宿舍的户口，由各单位指定专人，协助户口登记机关办理户口登记;分散居住的户口，由户口登记机关直接办理户口登记。居住在军事机关和军人宿舍的非现役军人的户口，由各单位指定专人，协助户口登记机关办理户口登记。农业、渔业、盐业、林业、牧畜业、手工业等生产合作社的户口，由合作社指定专人，协助户口登记机关办理户口登记。合作社以外的户口，由户口登记机关直接办理户口登记。
