具体缴纳的税款如下：
1、企业所得税
企业根据搬迁规划，异地重建后恢复原有或转换新的生产经营业务，用企业搬迁或处置收入购置或建造与搬迁前相同或类似性质、用途或者新的固定资产和土地使用权（以下简称重置固定资产），或对其他固定资产进行改良，或进行技术改造，或安置职工的，准予其搬迁或处置收入扣除固定资产重置或改良支出、技术改造支出和职工安置支出后的余额，计入企业应纳税所得额。
2、营业税
按照《国家税务总局关于土地使用者将土地使用权归还给土地所有者行为营业税问题的通知》（国税函〔2008〕277号）规定，纳税人将土地使用权归还给土地所有者时，只要出具县级（含）以上地方收回土地使用权的正式文件，无论支付征地补偿费的资金来源是否为财政资金，该行为均属于土地使用者将土地使用权归还给土地所有者的行为，不征收营业税。《国家税务总局关于收回土地使用权及纳税人代垫拆迁补偿费有关营业税问题的通知》（国税函又补充说，上述文件中关于县级以上（含）地方收回土地使用权的正式文件，包括县级以上（含）地方出具的收回土地使用权文件，以及土地管理部门报经县级以上（含）地方同意后由该土地管理部门出具的收回土地使用权文件。
3、土地
《土地条例》第规定，因国家建设需要依法征用、收回的房地产免征土地。《土地暂行条例实施细则》第十一条规定，条例第（二）项所称的因国家建设需要依法征用、收回的房地产，是指因城市实施规划、国家建设的需要而被批准征用的房产或收回的土地使用权。
4、印花税
由于印花税属于列举征收，而“搬迁补偿协议”不在列举范围内，此搬迁补偿收入也可以暂不缴纳印花税。
法律依据
《国有土地上房屋征收与补偿条例》 第 为了保障、促进国民经济和社会发展等公共利益的需要，有下列情形之一，确需要征收房屋的，由市、县级作出房屋征收决定：
（一）国防和外交的需要；
（二）由组织实施的能源、交通、水利等基础设施建设的需要；
（三）由组织实施的科技、教育、文化、卫生、体育、环境和资源保护、防灾减灾、文物保护、社会福利、市政公用等公共事业的需要；
（四）由组织实施的保障性安居工程建设的需要；
（五）由依照城乡规划法有关规定组织实施的对危房集中、基础设施落后等地段进行旧城区改建的需要；
（六）法律、行规规定的其他公共利益的需要。
