批捕后一般还是在侦查阶段，侦查结束后机关会将案件移交到，审查后，符合起诉条件的会向提起公诉。如果认为有些事实不清，会将案件退回要求补充侦查，如果认为不构成犯罪的，则不会起诉。
《刑事诉讼法》第九十一条：机关对被拘留的人，认为需要逮捕的，应当在拘留后的三日以内，提请人民审查批准。在特殊情况下，提请审查批准的时间可以延长一日至四日。
对于流窜作案、多次作案、结伙作案的重大嫌疑分子，提请审查批准的时间可以延长至三十日。
人民应当自接到机关提请批准逮捕书后的七日以内，作出批准逮捕或者不批准逮捕的决定。人民不批准逮捕的，机关应当在接到通知后立即释放，并且将执行情况及时通知人民。对于需要继续侦查，并且符合取保候审、监视居住条件的，依法取保候审或者监视居住。
一、司法机关的办理程序
1.人民审查批准逮捕，可以讯问犯罪嫌疑人；有下列情形之一的，应当讯问犯罪嫌疑人：
(1)对是否符合逮捕条件有疑问的；
(2)犯罪嫌疑人要求向检察人员当面陈述的；
(3)侦查活动可能有重大违法行为的。
人民审查批准逮捕，可以询问证人等诉讼参与人，听取辩护律师的意见；辩护律师提出要求的，应当听取辩护律师的意见。
2.批捕后，机关可以继续刑事侦查：
1)、对犯罪嫌疑人逮捕后的侦查羁押期限不得超过二个月。案情复杂、期限届满不能终结的案件，可以经上一级人民批准延长一个月。
2)、机关侦查终结的案件，应当做到犯罪事实清楚，证据确实、充分，并且写出起诉意见书，连同案卷材料、证据一并移送同级人民审查决定。
3)、人民对于机关移送起诉的案件，应当在一个月以内作出决定，重大、复杂的案件，可以延长半个月。
4)、人民审查案件，对于需要补充侦查的，可以退回机关补充侦查，也可以自行侦查。对于补充侦查的案件，应当在一个月以内补充侦查完毕。补充侦查以二次为限。补充侦查完毕移送人民后，人民重新计算审查起诉期限。
5)、人民认为犯罪嫌疑人的犯罪事实已经查清，证据确实、充分，依法应当追究刑事责任的，应当作出起诉决定，按照审判管辖的规定，向人民提起公诉。
6)、人民审理公诉案件，应当在受理后一个月以内宣判，至迟不得超过一个半月。
