自动离职时，如果员工是违法解除与公司的劳动合同，或者违反了劳动合同中约定的保密义务或竞业约定，而给公司造成损失的，需要赔偿给单位；如果没有上述情形的，一般不需要赔偿给单位。
自动离职，是职工根据企业和自身情况擅自离职，是强行解除与企业的劳动关系的一种行为。有的职工因辞职未准或要求解除合同未被同意，便擅自离职或违约出走；有的职工未说明原因不辞而别；也有的受优厚待遇诱惑而擅自“跳槽”等均属自动离职范围。
解除劳动合同、辞职与自动离职的不同是：
辞职、自动离职（又称擅自离职）是指劳动者解除与用人单位劳动关系的行为。在《劳动法》实施之后，也就是劳动者解除与用人单位劳动合同的行为。这就是解除劳动合同与辞职、自动离职的联系。它们的不同主要有以下两点：
不同点
解除劳动合同的运用主体可以是用人单位，也可以是劳动者。而辞职、自动离职的运用主体只是劳动者。
解除劳动合同适用的原因是双重性质的，既有惩罚性的，又有非惩罚性的。而辞职不具有惩罚性，自动离职往往是一种违法行为。
法律依据：《中华人民共和国劳动合同法》第二十二条
用人单位为劳动者提供专项培训费用，对其进行专业技术培训的，可以与该劳动者订立协议，约定服务期。
劳动者违反服务期约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用。用人单位要求劳动者支付的违约金不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。
第九十条
劳动者违反本法规章解除劳动合同，或者违反劳动合同中约定的保密义务或者竞业，给用人单位造成损失的，应当承担赔偿责任。
