1. 在部门管理权限方面，《保密法》原有的规定得到了进一步的细化。原法强调各级的保密职责，而《保密法实施条例》则明确将国家保密局定位为全国保密工作的监督和管理部门。这一变化体现了对保密工作的集中管理和统一指导。
2. 关于保密等级的划分，修订后的《保密法实施办法》增加了内部秘密的分类，使得保密等级体系更为细致。这有利于更精确地界定不同级别的信息，确保敏感信息的妥善管理。
3. 在保密审查程序上，《保密法实施条例》虽然规定了国家秘密变更、解除和公开等的审批流程，但《保密法实施办法》进一步明确了这些程序的细节。例如，它规定了审查的时限要求、标准化的流程以及审批机构的责任。这种细化的管理有助于提高保密工作的规范性和透明度。
